Часто бывают ситуации, когда организация-поставщик ликвидировалась, налоговая инспекция из-за этого отказывает в вычете. Можно спорить по этому вопросу. Согласно Налоговому кодексу, основанием для вычета НДС является приобретение товаров, принятие их на учет и оформление счет-фактуры. Больше ничего дополнительного не требуется. Поэтому когда налоговая инспекция требует убрать НДС из книги покупок и доначислить налог, то с ней можно спорить. Например, есть постановление Федерального Арбитражного Суда Северо-Кавказского округа от 15.04.2011 по делу № А20-939/2010, где и указано, что действия налоговых органов являются неправомерными в этом случае.