Det er aldrig sket før, at en regering i Danmark har hjemsendt sin spionledelse og givet Politiets Efterretningstjeneste lov til at døgnovervåge chefen for Forsvarets Efterretningstjeneste i et år for derefter at anholde, fængsle og tiltale ham og den tidligere forsvarsminister for landsskadelig virksomhed.
Senere er sagen faldet til jorden, fordi Højesteret krævede åbne døre og bekræftede landets største statshemmelighed gennem årtier — hemmeligheden om et dansk-amerikansk kabelsamarbejde.
I De aflyttede fortæller journalisten og forfatteren Hans Davidsen-Nielsen hele historien om, hvordan det kom så vidt, og hvordan han selv — som ”journalist E” i anklageskriftet — blev en ufrivillig del af det, der i dag kendes som FE-sagen.
Foruden beretningen om selve sagen rummer bogen interviews med blandt andre Lars Findsen, Claus Hjort Frederiksen og hidtil ukendte hovedpersoner, som har fået deres liv forandret for altid.