Междоусобицы в Саксонии не прекращались. Герцог и графы оспаривали богатые дарения императора архиепископам Магдебургскому и Гамбургско-Бременскому, а также епископам. Почву для конфликта создало и обращение в христианство полабских славян: духовенство вело среди них миссионерскую деятельность, а князья принуждали их к выплате большой дани. Оставленные в покое после заключения мира в Баутцене лютичи вторглись в Мекленбург, изгнали христианских князей ободритов и разрушили все церкви в этом краю. В 1019 году датский король Кнут, вероятно, по соглашению со своим родственником Болеславом, разгромил ободритов и вагров. Генрих не соединился с ним; в то время против него выступили мятежные саксонские графы. Достоверные сведения о восстании, о связях Генриха с Кнутом отсутствуют. Генрих покорил саксонских владык и простил их, а в 1020 году простил также и мятежного герцога Бернгарда, который в 1011 году унаследовал своему отцу. Впоследствии Генрих восстановил власть империи над ободритами. Эти помилования императором мятежников объяснялись, вероятно, усилиями установить справедливый компромисс — более ясных сведений о нем у нас нет — в разрешении территориальных и правовых претензий.