Биологическая химия изучает молекулярные процессы, лежащие в основе развития и функционирования организмов. Биохимия использует методы «молекулярных» наук: химии, физической химии, молекулярной физики, и в этом отношении биохимия сама является молекулярной наукой. Однако, главные конечные задачи биохимии лежат в области биологии: она изучает закономерности биологической, а не химической формы движения материи.