Родилась в Рунгштеде в аристократической семье. Получила домашнее образование, которое затем продолжила в копенгагенской Академии изящных искусств. В 1914 году вышла замуж за барона Бликсена-Финекке и вместе с мужем уехала в Кению, где они приобрели себекофейную плантацию. После развода (1921) еще десять лет оставалась в Африке, пока обстоятельства не вынудили ее вернуться в Данию.
В 1937 году Карен Бликсен опубликовала книгу воспоминаний "Из Африки". Эта книга мгновенно стала чрезвычайно популярной.В 1943 году был опубликован сборник "Семь готических историй", а в 1944 году увидел свет единственный роман Бликсен "Ангельские мстители" (под псевдонимом Пьер Андрезель.
На Западе весьма популярен писатель Исак Динесен, но лишь литературоведам известно, что это - псевдоним Карен Бликсен.