Niller og hans kammerater er på vej til skole, da Den Sorte Ninja pludselig springer frem. Niller må skynde sig at forvandle sig til ninja, så han kan tage kampen op mod Den Sorte Ninja.
Rune Fleischer er en dansk illustrator og forfatter. Han står bag en lang række populære børnebøger blandt andre serierne "Ninja Niller" og "Otto".